Открыт в 1932 году одновременно с основанием педагогического института.

В профессиональной подготовке студентов важным является их приобщение к научно-исследовательской работе. Результаты исследований преподавателей и студентов представляются на симпозиумах в Москве, во Франции, Германии, Португалии, Чехии, Японии и др. Большую часть внеучебного времени студенты проводят в лабораториях для подготовки выпускных квалификационных работ и выполнения научных исследований. Студенты под руководством преподавателей кафедр ботаники, зоологии и экологии выезжают на полевые практики и в экспедиции. На кафедре ботаники создан один из крупнейших в России гербарий растений им. Л.М. Черепнина.

На факультете имеется аспирантура по семи направлениям.